Schronisko Vltava dysponuje 11 pokoi z różnym standardzie zakwaterowania.
Parter - 4 pokoje z WC i prysznicem: 2x pokoje dla czterech osób, 1x dla pięć osób i 1x dla sześć osób, wyposażona kuchnia, prywatny bar z piwem, salonik z TV i fortepian.
Pierwszy piętro - 6 pokoi: 4 pokoje dla 3-4 osób (łazienką dzieloną - 2 toalety + 2 prysznice), 1x pięć-osobowy pokój i łazienką, 1 pokój dwuosobowy i łazienką, salonik i kuchnia.
Piwnica - pokój dla 5-6 osób z osobnym WC i łazienką w poprzek pokoju.